62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2939 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 126 aa  256  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  61.42 
 
 		 126 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  27.63 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  31.3 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  33.09 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  29.8 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  32 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  31.01 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  27.08 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.5 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  33.06 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  33.58 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  28.24 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  30.71 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  28.57 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  29.6 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  32.14 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  28.36 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  28.85 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  28.36 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  40.28 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  32.2 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  30.4 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  31.65 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.36 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  51.16 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  26.61 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  27.88 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 578 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  37.1 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  37.1 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  31.03 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.12 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  28.7 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  31.43 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  35.53 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>