57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1634 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  43.24 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  42.67 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  49.25 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  36.59 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  35.9 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  34.78 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 346 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  30.26 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 416 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  35 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.68 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 170 aa  43.9  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  46.51 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  30.88 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  37.93 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  31.71 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  35.85 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 86 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 164 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2057  phage shock protein C, PspC  32.35 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.855415  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  37.14 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  35.85 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  38.71 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  38.71 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2164  hypothetical protein  36.92 
 
 		 154 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.771382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>