37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0807 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2377  phage shock protein C, PspC  57.58 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  34.92 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  40.68 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05619  PspC domain superfamily  38.89 
 
 		 52 aa  43.9  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0146785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  27.87 
 
 		 65 aa  43.5  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  32.79 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  32.79 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  32.2 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 		 61 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28830  putative stress-responsive transcriptional regulator  51.22 
 
 		 57 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  26.23 
 
 		 65 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 552 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  52.38 
 
 		 547 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5724  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 383 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  31.67 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  31.15 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2212  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 71 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>