111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2413 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
67 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05619  PspC domain superfamily  82.69 
 
 
52 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0146785  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  57.38 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  60 
 
 
62 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  55.93 
 
 
61 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  53.97 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  54.1 
 
 
233 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  47.69 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2212  phage shock protein C, PspC  66.67 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2057  phage shock protein C, PspC  60.34 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.855415  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  40.62 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  45.76 
 
 
61 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  49.09 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  47.62 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  45 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.68 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
174 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  46.67 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  46.27 
 
 
164 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  39.71 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  46.27 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  38.71 
 
 
244 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
184 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  50.98 
 
 
547 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 
111 aa  47  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  33.87 
 
 
240 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 
81 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  29.03 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
400 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 
417 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  42.59 
 
 
445 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  36.07 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28830  putative stress-responsive transcriptional regulator  60.61 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 
552 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40.68 
 
 
419 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 
578 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  40.3 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  27.42 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
394 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
306 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 
418 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 
256 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  33.9 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 
474 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  33.9 
 
 
582 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  44.9 
 
 
82 aa  42  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
138 aa  42  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  34.43 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  34.43 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 
416 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
82 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 
452 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
399 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 
497 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  51.28 
 
 
464 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
398 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  36.07 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  36.07 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  36.07 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  36.07 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
477 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>