65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01250 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  503  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.89 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  45.16 
 
 		 82 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  39.58 
 
 		 97 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  45.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  35.8 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  28.35 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  38.1 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  47.76 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  47.69 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 103 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  43.28 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 71 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 61 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  43.08 
 
 		 86 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 92 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 87 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  45.9 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  41.1 
 
 		 81 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 394 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 64 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  36.11 
 
 		 578 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 847 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 127 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  32.97 
 
 		 515 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 174 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  31.94 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  35.82 
 
 		 82 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 143 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 416 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 108 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  38.67 
 
 		 119 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 67 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 		 86 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  31.03 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 86 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 68 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 		 77 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 98 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  27.14 
 
 		 170 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  42.37 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  34.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  42.55 
 
 		 81 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 83 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 84 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  32.2 
 
 		 65 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  40.35 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  32.2 
 
 		 65 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 62 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  42.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 		 66 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 77 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  48.89 
 
 		 161 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  32.65 
 
 		 419 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>