157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4820 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 66 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  57.14 
 
 		 174 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  53.57 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  53.57 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  58.62 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  53.57 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  53.45 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  50.79 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  53.45 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  48.39 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  53.57 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  56.14 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  52 
 
 		 416 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  61.9 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  51.06 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  50 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  50.94 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  43.1 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  44.9 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  55.32 
 
 		 445 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  43.94 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  52.08 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  56.36 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  37.29 
 
 		 515 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  45.76 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  38.6 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  36.21 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40 
 
 		 419 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  51.11 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  51.02 
 
 		 491 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 190 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  57.14 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  48.84 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  53.06 
 
 		 400 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 847 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 512 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 398 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  42.31 
 
 		 70 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2452  phage shock protein C, PspC  58.33 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000523744  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  47.92 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  46.3 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  31.15 
 
 		 578 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  48.39 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  40.35 
 
 		 244 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 497 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  37.93 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  43.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 484 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 533 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  51.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 547 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  38.98 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>