122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1297 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  86.05 
 
 		 86 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  88.37 
 
 		 86 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  65.71 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  55.93 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  55.74 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  53.57 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  58.73 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  54.39 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  50.79 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  39.24 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  50.79 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  52.54 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  37.08 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  32.93 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  44.64 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  44.64 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  55.17 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  34.09 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  39.29 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  32.79 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  56.76 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  40.98 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  40.85 
 
 		 244 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  33.9 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  39.29 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  39.29 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  36.51 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  41.46 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  32.88 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 398 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  27.45 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  38.6 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  43.48 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 416 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  51.35 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.94 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.94 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.94 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  35.09 
 
 		 178 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  40.28 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  32.88 
 
 		 515 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.97 
 
 		 256 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  54.05 
 
 		 400 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  35.48 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  46.34 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  36.84 
 
 		 582 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  36.84 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.22 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.81 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.22 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  27.59 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  47.73 
 
 		 847 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  29.76 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  34.55 
 
 		 445 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  38.78 
 
 		 474 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  53.66 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01260  putative stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  33.9 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  33.96 
 
 		 555 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>