22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01260  putative stress-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  265  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 152 aa  47.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 190 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  30.38 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  35.09 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  35.71 
 
 		 65 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  43.66 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4752  phage shock domain-containing protein  26.39 
 
 		 76 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>