140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3236 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  100 
 
 		 129 aa  251  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  50.7 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  52.63 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  55.56 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  58.33 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  52.54 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.21 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  52.63 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  50.91 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  54.17 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  34.72 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 62 aa  57  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  48.48 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  37.7 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  53.45 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 497 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  29.6 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  29.35 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  47.62 
 
 		 346 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  30.16 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28830  putative stress-responsive transcriptional regulator  59.65 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 458 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  43.28 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  40.68 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  38.16 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  38.6 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 847 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 547 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 512 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  43.33 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 552 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  37.88 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.22 
 
 		 416 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  32.2 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  32.2 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  34.48 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  34.48 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  40.62 
 
 		 445 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  35.09 
 
 		 419 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 511 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 533 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  45.65 
 
 		 417 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  34.69 
 
 		 464 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  38.24 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  40.82 
 
 		 491 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 484 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  28.81 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  28.81 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>