39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0654 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 464 aa  903    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  31.36 
 
 		 547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  55.56 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 552 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  41.45 
 
 		 512 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  43.97 
 
 		 468 aa  90.9  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  42.45 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  45.33 
 
 		 86 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  31.98 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 		 85 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  43.56 
 
 		 136 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  24.46 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  28.75 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  26.14 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2395  phage shock protein C, PspC  41.77 
 
 		 84 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.068656  normal  0.225088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 103 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  29.6 
 
 		 306 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 86 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 92 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 77 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 97 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  48.15 
 
 		 178 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  32.88 
 
 		 244 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  34.69 
 
 		 129 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  31.62 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  39.22 
 
 		 61 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  23.97 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 81 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  38.16 
 
 		 100 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 82 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  38.78 
 
 		 174 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 847 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  33.96 
 
 		 184 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  38.89 
 
 		 582 aa  43.1  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>