59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2395 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2395  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 84 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.068656  normal  0.225088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  45.95 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  44.59 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  45.88 
 
 		 464 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  43.04 
 
 		 552 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  39.47 
 
 		 512 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  38.96 
 
 		 547 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  38.75 
 
 		 497 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.26 
 
 		 533 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  33.96 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 416 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  37.04 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 138 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  40.32 
 
 		 491 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.39 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 394 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  32.86 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  38.46 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  31.15 
 
 		 515 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  28.57 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.14 
 
 		 354 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  34.55 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  42.55 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  42.68 
 
 		 468 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  35.38 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0734  phage shock protein C, putative  25 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  35.09 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  34.62 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  34.69 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 346 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  31.48 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 466 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 417 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  30.36 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  31.43 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  34.18 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  35.42 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  35.85 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  30.91 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4752  phage shock domain-containing protein  37.29 
 
 		 76 aa  40  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>