76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0861 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  60.26 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  55.84 
 
 		 83 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  46.91 
 
 		 533 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  51.35 
 
 		 512 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  45.33 
 
 		 464 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  45.57 
 
 		 547 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  41.56 
 
 		 491 aa  63.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  43.42 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  43.08 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  39.47 
 
 		 552 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  48.61 
 
 		 468 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  51.52 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  54.17 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  42 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  45.83 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  40.82 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  40.82 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  41.51 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  37.18 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 484 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 419 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.94 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  46.81 
 
 		 445 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  39.58 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  36.73 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  53.12 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  39.22 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  39.22 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 61 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  45.83 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  39.39 
 
 		 555 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2395  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.068656  normal  0.225088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 77 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 		 107 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 477 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 398 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  30.65 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  37.25 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  30.91 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 394 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 474 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  39.58 
 
 		 240 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  36.54 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 416 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 847 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  32.08 
 
 		 177 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  32.14 
 
 		 68 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  33.9 
 
 		 582 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>