80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2032 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 61 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  54.24 
 
 		 62 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  55.93 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  46.67 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05619  PspC domain superfamily  56 
 
 		 52 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0146785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.46 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  55.17 
 
 		 419 aa  60.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  49.06 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  44.83 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.68 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2057  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.855415  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 		 477 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2212  phage shock protein C, PspC  51.72 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  38.98 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  44.07 
 
 		 419 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 394 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  53.57 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  40.68 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 466 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28830  putative stress-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  40.68 
 
 		 582 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  33.9 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 847 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 484 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  45.61 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  35.09 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 480 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 		 77 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 85 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 86 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 194 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  45.1 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  36.84 
 
 		 240 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.21 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 578 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 108 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 427 aa  40  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>