67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3035 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 497 aa  927    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  33.75 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  33.2 
 
 		 547 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  32.27 
 
 		 512 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  55.83 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  61.82 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  39.92 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  52.94 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  37.34 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  61.62 
 
 		 136 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.16 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  28.57 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  43.42 
 
 		 86 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  25.86 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  52.83 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  26.72 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  35.44 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 92 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  42.03 
 
 		 85 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 81 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 83 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  44.64 
 
 		 129 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  32.52 
 
 		 127 aa  53.5  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  37.17 
 
 		 555 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 174 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  36.62 
 
 		 86 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 152 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 161 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  43.24 
 
 		 100 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  50.98 
 
 		 416 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.32 
 
 		 86 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 394 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  43.1 
 
 		 127 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.3 
 
 		 2179 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 97 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 847 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 66 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 85 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  48.98 
 
 		 127 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  41.67 
 
 		 82 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 95 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 177 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  37.7 
 
 		 240 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  48.98 
 
 		 108 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 143 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  45.83 
 
 		 194 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 76 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 110 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 110 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 103 aa  47  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 107 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 110 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  30.57 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 138 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 82 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.3 
 
 		 2914 aa  45.4  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 71 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 68 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 114 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  43.14 
 
 		 61 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  40.85 
 
 		 84 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 165 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 98 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>