39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0708 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 552 aa  1061    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  33.78 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  27.91 
 
 		 547 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  48.25 
 
 		 533 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  38.92 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  58.25 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  40.86 
 
 		 497 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  43.24 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  53.41 
 
 		 136 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.22 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  39.47 
 
 		 86 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  40.85 
 
 		 85 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 83 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  30.95 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  26.35 
 
 		 511 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 174 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  40.62 
 
 		 178 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 152 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 138 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  42.86 
 
 		 129 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  27.87 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  40.51 
 
 		 100 aa  47.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  35.9 
 
 		 161 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 108 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 		 248 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 92 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 67 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 86 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 62 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 97 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 164 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 68 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  37.29 
 
 		 244 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  43.14 
 
 		 61 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  40 
 
 		 127 aa  43.9  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>