154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3366 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  100 
 
 		 127 aa  263  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  53.68 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  45.26 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.83 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  54.39 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  53.45 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  51.79 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  49.15 
 
 		 419 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  57.14 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  36.11 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  42.47 
 
 		 445 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  42.47 
 
 		 511 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  42.35 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  48.28 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.55 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  46.55 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  46.38 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40.96 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  40.62 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  40.85 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  37.68 
 
 		 474 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  43.86 
 
 		 555 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.37 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.69 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 512 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  43.14 
 
 		 416 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  29.6 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 400 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  41.07 
 
 		 445 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 481 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  40.35 
 
 		 515 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  40.98 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 233 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 547 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  34.41 
 
 		 578 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 497 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  33.78 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 847 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  35.9 
 
 		 464 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 427 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  33.9 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  51.16 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 346 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  36.71 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 399 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  41.46 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  46.51 
 
 		 436 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  32.39 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  43.75 
 
 		 491 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>