171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1660 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 127 aa  244  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  92.91 
 
 		 127 aa  209  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  65 
 
 		 61 aa  84.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  38.57 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  32.9 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  55.93 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  56.45 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  52.31 
 
 		 177 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  46.03 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  45.95 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  55.22 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  43.42 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  55.17 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  58.18 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  53.33 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  45.59 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  51.72 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  40.95 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  32.89 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  29.66 
 
 		 474 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  55.36 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  52.31 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.94 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  48.33 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  42.86 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  45.68 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  43.1 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  46.15 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  39.51 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  44.29 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  39.44 
 
 		 847 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  43.55 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  54 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  41.25 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  35.11 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  65.79 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  33.61 
 
 		 511 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 398 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 394 aa  57.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  45.45 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2452  phage shock protein C, PspC  33.77 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000523744  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  41.79 
 
 		 582 aa  57.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  53.97 
 
 		 346 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.13 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  50 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  37.31 
 
 		 578 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  41.43 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 512 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  45.61 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  58.14 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  33.75 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  43.1 
 
 		 515 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40.68 
 
 		 419 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.37 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  55.26 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  37.68 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 497 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  37.76 
 
 		 306 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  31.93 
 
 		 445 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  38.55 
 
 		 491 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  32.5 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 248 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  43.06 
 
 		 233 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>