129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4864 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  38.3 
 
 		 177 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.76 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  40.87 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  47.96 
 
 		 85 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  31.15 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  54.84 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40.86 
 
 		 81 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.08 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  27.69 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  34.59 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  48.28 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  48.28 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  25 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  40.79 
 
 		 107 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  24.68 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  45.76 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  37.33 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40 
 
 		 419 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  44.83 
 
 		 61 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 61 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 58 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 61 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  50.85 
 
 		 97 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  46.55 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 847 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  32.35 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 86 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  34.44 
 
 		 131 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 103 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  36.9 
 
 		 86 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  46.55 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  35.79 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 66 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  52.38 
 
 		 77 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 127 aa  52  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 127 aa  51.6  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 61 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 64 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  32.18 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  32.18 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  32.18 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 		 62 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  37.5 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01260  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.27 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  31.82 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  31.82 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  51.06 
 
 		 86 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  31.82 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  31.82 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  31.82 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  26.74 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 119 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  31.82 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 87 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 59 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 74 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  31 
 
 		 131 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  31.11 
 
 		 131 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  30.94 
 
 		 346 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 416 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 306 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 67 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  31.11 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  55.56 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 466 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  38.46 
 
 		 79 aa  45.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 481 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 394 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  39.39 
 
 		 445 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 96 aa  45.1  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  39.34 
 
 		 70 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  36.84 
 
 		 136 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 449 aa  44.7  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 511 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  45.1 
 
 		 491 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 419 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>