56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6527 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 417 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.91 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  30.85 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  32.23 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  30.95 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0913  phage shock protein C, PspC  35.12 
 
 		 467 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  29.25 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  28.46 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  26.03 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 96 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  44.19 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 96 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  36.63 
 
 		 98 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 97 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  35.4 
 
 		 547 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  33.86 
 
 		 512 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  38.95 
 
 		 555 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  35.14 
 
 		 86 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  38.96 
 
 		 178 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  36.22 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 71 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.75 
 
 		 533 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 127 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 86 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 127 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  47.73 
 
 		 129 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  43.14 
 
 		 59 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 67 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 92 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 68 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  28.89 
 
 		 174 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  41.98 
 
 		 169 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 143 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  51.92 
 
 		 82 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  32.31 
 
 		 66 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  43.14 
 
 		 77 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  42.25 
 
 		 164 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 64 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  31.75 
 
 		 95 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 177 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.3 
 
 		 81 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  31.75 
 
 		 82 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  33.73 
 
 		 131 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 85 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  31.08 
 
 		 127 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 62 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>