80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3224 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 143 aa  293  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  58.82 
 
 		 193 aa  153  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  57.89 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  54.17 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  34.38 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  34.4 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  34.4 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  33.07 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  33.6 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  33.6 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  33.6 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  32.8 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  30.16 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  34.13 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  32.28 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  32.52 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  32.35 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  31.75 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  30.65 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  31.3 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.09 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  27.73 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  28.16 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.67 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.15 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.12 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.12 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.12 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  25.69 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  32.14 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  54.76 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  56.1 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  26.36 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 		 233 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  26.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  26.36 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 346 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 177 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  28.87 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  44.68 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  45.24 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.21 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  24.46 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  26.27 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  43.06 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  37.93 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  43.06 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  39.58 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 430 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  33.85 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  36.59 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.83 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  25.38 
 
 		 119 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  25.38 
 
 		 119 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  46.51 
 
 		 515 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  25.38 
 
 		 119 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 127 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  25.38 
 
 		 119 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  25.38 
 
 		 119 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>