20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0448 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0448  zinc finger, RanBP2-type  100 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  46 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  46 
 
 		 330 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  46 
 
 		 323 aa  52  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40 
 
 		 1149 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  42 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.373949 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03597  ubiquitination network signaling protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12790)  38.55 
 
 		 996 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.748765 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  39.22 
 
 		 1151 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.93 
 
 		 360 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  38.18 
 
 		 1148 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  36.92 
 
 		 295 aa  45.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 		 1151 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.97 
 
 		 1291 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1456  FHA domain containing protein  38.6 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1482  FHA domain containing protein  38.6 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.30072  normal  0.365502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0499  zinc finger RanBP2-type  58.33 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  36.54 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0667  hypothetical protein  36.23 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.747823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  30.14 
 
 		 284 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>