11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0499 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0499  zinc finger RanBP2-type  100 
 
 
256 aa  500  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0433  hypothetical protein  33.18 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 
167 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0448  zinc finger, RanBP2-type  45 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  63.64 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  61.9 
 
 
340 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  59.09 
 
 
171 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  36.21 
 
 
1148 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  58.33 
 
 
330 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1885  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000268985  normal  0.937272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  36.21 
 
 
1151 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>