38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2031 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2031  zinc finger RanBP2-type  100 
 
 		 334 aa  670    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  28.8 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  25.45 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 208 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 629 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 578 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 190 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 207 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 589 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.09 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  42.59 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  31.91 
 
 		 505 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 762 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 878 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.29 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.31 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 200 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 		 1105 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.08 
 
 		 795 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  22.64 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  41.51 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0209  hypothetical protein  52.63 
 
 		 142 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.67 
 
 		 732 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 715 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 		 1151 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  41.51 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  39.62 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  35.71 
 
 		 155 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.76 
 
 		 979 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1406 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 766 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 187 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>