103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4434 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  51.7 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  29.28 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  34.23 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  34.23 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 586 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1104 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2031  zinc finger RanBP2-type  28.8 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 544 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.19 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 374 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 556 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 111 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 519 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 577 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 923 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.28 
 
 		 887 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 1061 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 199 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 586 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.53 
 
 		 1979 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.45 
 
 		 573 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.79 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3982  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 603 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30.77 
 
 		 661 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.64 
 
 		 708 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 762 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.43 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.43 
 
 		 637 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 		 1034 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 638 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.96 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0602  RNA polymerase alpha subunit domain protein  28.41 
 
 		 451 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0470  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 1070 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524501  normal  0.148928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 589 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.96 
 
 		 561 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 495 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 883 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  32.39 
 
 		 407 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 3301 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 409 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.73 
 
 		 635 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 417 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.79 
 
 		 582 aa  45.8  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1049 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1133 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  32.56 
 
 		 1004 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1276 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35663  predicted protein  29.31 
 
 		 502 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00548899  normal  0.928712 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 533 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1450 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 927 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 714 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  23.2 
 
 		 1077 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.79 
 
 		 816 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 4079 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  22.14 
 
 		 474 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 827 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.21 
 
 		 1067 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.4 
 
 		 979 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.87 
 
 		 503 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  23.26 
 
 		 1237 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  25.74 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  23.36 
 
 		 816 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  23.2 
 
 		 389 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 685 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 520 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 589 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0799  hypothetical protein  28.24 
 
 		 187 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00593495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 565 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 767 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  30.93 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  24.78 
 
 		 475 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 		 188 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 364 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 722 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  23.84 
 
 		 737 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 409 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 860 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>