95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5981 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  51.37 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  28.95 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  33.6 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  33.6 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.32 
 
 		 887 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2031  zinc finger RanBP2-type  25.45 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 544 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 923 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25 
 
 		 708 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1104 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 556 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 1184 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.27 
 
 		 561 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  33.66 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.27 
 
 		 561 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 750 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.13 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.15 
 
 		 586 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.71 
 
 		 725 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 3145 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.98 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 495 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 714 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  26.7 
 
 		 519 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1133 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 637 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.93 
 
 		 863 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 638 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  28.07 
 
 		 1230 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 638 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 409 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.57 
 
 		 587 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 		 1385 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.52 
 
 		 503 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.26 
 
 		 1067 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  22.13 
 
 		 677 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1620  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.45 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 589 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 		 1979 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.36 
 
 		 884 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.77 
 
 		 577 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 567 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3150  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 490 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 494 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 883 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  22.67 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1005 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2384  N-acetylglucosaminyl transferase-like protein  28.57 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.22 
 
 		 566 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 715 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 762 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1198 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 732 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  23.76 
 
 		 398 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.17 
 
 		 988 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 617 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 1073 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.09 
 
 		 372 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 1061 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 615 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3982  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 603 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 404 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 1077 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  34.38 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.13 
 
 		 801 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 629 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 748 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  34.38 
 
 		 428 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 784 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>