100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0987 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 187 aa  386  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.16 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 195 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  35.56 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1473  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00324934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.59 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0241049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  31.65 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2363  hypothetical protein  30.53 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 1005 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 1034 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  28.12 
 
 		 417 aa  51.2  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  22 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 4079 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.53 
 
 		 267 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1600  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  25 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 1230 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3145 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.18 
 
 		 887 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 593 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  31.76 
 
 		 561 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 357 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 545 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.52 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 		 417 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.6 
 
 		 689 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1970  tetratricopeptide TPR_2  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 713 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.59 
 
 		 561 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  29.76 
 
 		 298 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  23.08 
 
 		 582 aa  45.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0541  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.97 
 
 		 2401 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 568 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 552 aa  44.7  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 767 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  26.42 
 
 		 542 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  34.74 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0333  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000188305  normal  0.0509123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 1069 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 566 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  24.55 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 		 466 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 366 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1096 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 576 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.95 
 
 		 1979 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 1737 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 597 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.44 
 
 		 587 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 466 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 		 734 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.25 
 
 		 733 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  23.08 
 
 		 379 aa  42.4  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4917  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000226435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0152  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 273 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.072863  hitchhiker  0.00176598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 499 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 545 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 		 453 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3260  tetratricopeptide TPR_2  34.85 
 
 		 434 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.47 
 
 		 237 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 878 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.43 
 
 		 557 aa  41.6  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 828 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 884 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 632 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 542 aa  41.2  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 883 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3714  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 592 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25 
 
 		 676 aa  41.2  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 		 1056 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 		 265 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2768  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 265 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.66 
 
 		 577 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  23.66 
 
 		 577 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>