47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3150 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3150  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
490 aa  1000    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2973  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.62 
 
 
493 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000338654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5263  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 
528 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4952  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
503 aa  326  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5244  TPR domain protein  36.29 
 
 
503 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4837  TPR domain-containing protein  36.29 
 
 
503 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5320  TPR domain protein  36.29 
 
 
503 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5388  TPR domain-containing protein  36.09 
 
 
503 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5008  TPR domain-containing protein  36.09 
 
 
503 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0718057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5679  TPR domain protein  36.29 
 
 
503 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4852  TPR domain-containing protein  36.09 
 
 
503 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5278  TPR domain protein  36.29 
 
 
503 aa  323  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.477554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3702  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 
503 aa  316  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.61 
 
 
587 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 
461 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.548615  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0431  yvcD protein  22.41 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0787  TPR repeat-containing protein  20.41 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0804  TPR repeat-containing protein  20.41 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0390  hypothetical protein  19.92 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
589 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 
616 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
615 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
870 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
646 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
594 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
686 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.82 
 
 
1979 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 
2240 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.96 
 
 
745 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3075  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
240 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
649 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
649 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.3 
 
 
739 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  33.33 
 
 
708 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  28.7 
 
 
298 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  21.2 
 
 
762 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  21.2 
 
 
762 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
878 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  35.94 
 
 
105 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
221 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 
306 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 
383 aa  43.5  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  28.5 
 
 
444 aa  43.5  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0962  TPR repeat-containing protein  40.28 
 
 
279 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.12 
 
 
237 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
955 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  27.73 
 
 
725 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>