55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2973 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2973  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 493 aa  1021    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000338654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3150  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.6 
 
 		 490 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5679  TPR domain protein  38.37 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5320  TPR domain protein  37.43 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5263  TPR domain-containing protein  37.43 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4837  TPR domain-containing protein  37.23 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5244  TPR domain protein  37.23 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5278  TPR domain protein  37.82 
 
 		 503 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.477554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5008  TPR domain-containing protein  37.23 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0718057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5388  TPR domain-containing protein  37.23 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4852  TPR domain-containing protein  37.23 
 
 		 503 aa  346  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4952  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3702  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.548615  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0431  yvcD protein  20.62 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0787  TPR repeat-containing protein  19.83 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0804  TPR repeat-containing protein  19.83 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0390  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 795 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.1 
 
 		 729 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.65 
 
 		 927 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.72 
 
 		 924 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.63 
 
 		 745 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 		 1737 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 345 aa  47  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  22.48 
 
 		 1077 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 878 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.57 
 
 		 156 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 827 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  27.18 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.24 
 
 		 810 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 567 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 224 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 594 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 220 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 955 aa  44.3  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 607 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 		 1069 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 156 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 357 aa  43.5  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  22.16 
 
 		 607 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 221 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 3145 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.12 
 
 		 1044 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 156 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 274 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 607 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 		 906 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  25.52 
 
 		 656 aa  43.5  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 546 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>