28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0390 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  958    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.548615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 587 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2973  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000338654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3150  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.06 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 762 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5679  TPR domain protein  22.04 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1192 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4952  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 503 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 927 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5278  TPR domain protein  21.73 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.477554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5320  TPR domain protein  21.47 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5008  TPR domain-containing protein  21.09 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0718057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5244  TPR domain protein  21.09 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3702  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5388  TPR domain-containing protein  21.09 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4852  TPR domain-containing protein  21.09 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4837  TPR domain-containing protein  21.09 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5263  TPR domain-containing protein  21.47 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1090 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 827 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 878 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 4079 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 356 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 518 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4301  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406426  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 589 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 505 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>