184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3982 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3982  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 603 aa  1242    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2375  hypothetical protein  23.73 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.99 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 762 aa  67.4  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.64 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 		 988 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.89 
 
 		 589 aa  60.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 818 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 3145 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1450 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.74 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1056 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.78 
 
 		 321 aa  57  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.92 
 
 		 267 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 		 784 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 374 aa  57  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.5 
 
 		 733 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.38 
 
 		 689 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1421 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.53 
 
 		 535 aa  56.2  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 573 aa  55.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  30.19 
 
 		 467 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.64 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 648 aa  54.3  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 597 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 1034 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 602 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.38 
 
 		 1979 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1005 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.32 
 
 		 875 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 792 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.57 
 
 		 758 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.46 
 
 		 1266 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.74 
 
 		 1737 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 795 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.81 
 
 		 676 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.49 
 
 		 1056 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.97 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 226 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.72 
 
 		 566 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 311 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  28.73 
 
 		 456 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.59 
 
 		 314 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 265 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 266 aa  51.2  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  29.85 
 
 		 246 aa  51.2  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 706 aa  51.2  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 789 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 291 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 162 aa  51.2  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 3301 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 3172 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 574 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.41 
 
 		 725 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 615 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 1459 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.27 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.15 
 
 		 1154 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.38 
 
 		 462 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4301  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 361 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406426  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 375 aa  50.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 808 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 291 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 927 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  26.69 
 
 		 259 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 245 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 890 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 280 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.88 
 
 		 626 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 700 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 3560 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.37 
 
 		 354 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  27.73 
 
 		 282 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0351  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 553 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 361 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 331 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 602 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.59 
 
 		 614 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.59 
 
 		 614 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 614 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.59 
 
 		 626 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 646 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 		 639 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 649 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 649 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 616 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 754 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>