123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0127 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  31.02 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  28.37 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  30.37 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 917 aa  60.1  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.5 
 
 		 810 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.2 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 878 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 968 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 632 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 620 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 637 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 635 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 635 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 611 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 612 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.15 
 
 		 875 aa  52.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 636 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 639 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 626 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5432  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.91 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 3301 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 1252 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 573 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.74 
 
 		 887 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 1252 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.41 
 
 		 622 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.47 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 602 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 610 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.73 
 
 		 573 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.63 
 
 		 681 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.91 
 
 		 587 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28 
 
 		 725 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.42 
 
 		 545 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  33.85 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  27.82 
 
 		 398 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1127 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 1737 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  33.85 
 
 		 561 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.65 
 
 		 1979 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 626 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 626 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 718 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 614 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  30.16 
 
 		 889 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 4079 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 927 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 566 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 3172 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.08 
 
 		 742 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.33 
 
 		 1056 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 681 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.59 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 700 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1421 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 574 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 566 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.11 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 486 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 1827 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  29.76 
 
 		 519 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3387  TPR domain protein  31.58 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 		 1073 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0037  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 543 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.38 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 573 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  27.56 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.09 
 
 		 594 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 847 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 		 1067 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.16 
 
 		 602 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 784 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>