14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0296 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542313  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0077  hypothetical protein  50.17 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  42.65 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  43.4 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.48 
 
 		 369 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  40.32 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  38.71 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.92 
 
 		 368 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  45.24 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0919  hypothetical protein  36 
 
 		 1131 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0946  hypothetical protein  36 
 
 		 1131 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  42.86 
 
 		 424 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0961  hypothetical protein  25.4 
 
 		 193 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>