47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2636 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  58.06 
 
 		 125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  43.33 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  41.75 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  41.24 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2427  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4161  hypothetical protein  37 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.33 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.33 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.21 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  28.85 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  32.5 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.25 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 258 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0866  Xre family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  33.8 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  39.13 
 
 		 342 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2600  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 403 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 276 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 189 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>