39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0110 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 115 aa  222  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  96.52 
 
 		 115 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  89.57 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  47.97 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  47.92 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  37.21 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.63 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.63 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  51.16 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.63 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  48.84 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  29.7 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 103 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>