37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0339 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 115 aa  219  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  90.43 
 
 		 115 aa  199  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  89.57 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  43.75 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  39 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 164 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  37.65 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  30.85 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  51.16 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  48.84 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  29.13 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  43.08 
 
 		 216 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.26 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>