25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2434 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  99.31 
 
 		 144 aa  293  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  99.22 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  38.41 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  37.96 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 164 aa  96.7  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  38.17 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  35.78 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  37.65 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.53 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 403 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>