24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1316 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  33.67 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2427  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  35.42 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  35.38 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>