24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2427 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2427  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  210  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  46.51 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  42.16 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  37 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  38.82 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.86 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  38.27 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.51 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.51 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  44.16 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>