49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3589 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  200  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4161  hypothetical protein  69.31 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.54 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  34.65 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.37 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.37 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0160  helix-turn-helix domain protein  34.69 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2427  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2742  helix-turn-helix domain protein  45.76 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.224201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  40 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 406 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 179 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 68 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  36.26 
 
 		 198 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 115 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  45.28 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 176 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2600  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0866  Xre family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 256 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 123 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1547  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 102 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.358445  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 90 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3267  addiction module antidote protein  45.9 
 
 		 99 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>