16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4226 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  97.47 
 
 		 114 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  93.24 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  93.24 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  69.74 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  40 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4161  hypothetical protein  38.67 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  46 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 123 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0160  helix-turn-helix domain protein  30.56 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1055  Xre family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>