26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0160 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0160  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 103 aa  206  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0997  transcriptional regulator, putative  41.86 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.729204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0866  Xre family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4195  hypothetical protein  43.88 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.315174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  34.04 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.69 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4161  hypothetical protein  31.13 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0494  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 115 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1061  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.73 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2600  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4377  hypothetical protein  37.88 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.184663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04070  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>