32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3752 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  93 
 
 		 104 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  93 
 
 		 104 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  72.64 
 
 		 114 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  97.47 
 
 		 79 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  43.53 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4161  hypothetical protein  38.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  29.91 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  28.42 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2427  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  33.82 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  28.42 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  42.31 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1055  Xre family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0866  Xre family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0160  helix-turn-helix domain protein  31 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 73 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>