45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2729 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 431 aa  850    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.37 
 
 		 418 aa  316  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  41.63 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  38.29 
 
 		 412 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  35.61 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  31.59 
 
 		 473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  32.2 
 
 		 537 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  32.49 
 
 		 400 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  28.92 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  29.8 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  28.24 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  30.23 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  30.71 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  28.89 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  34.18 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  28.57 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  31.25 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  27.65 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6193  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.51 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  27.98 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  26.83 
 
 		 519 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  26.58 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  29.44 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  26.95 
 
 		 579 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 277 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  42.62 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1947  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.505699  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  30.32 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  31.75 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  32.74 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1056  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 135 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  24.22 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  53.66 
 
 		 162 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 770 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>