26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6698 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 412 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  37.47 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  38.68 
 
 		 431 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.68 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  26.27 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  26.1 
 
 		 473 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  29.51 
 
 		 484 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  27.73 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  35.15 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  26.88 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  31.13 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  28.51 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  30.28 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  24.24 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  26.16 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  23.47 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  28.11 
 
 		 526 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  29.49 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  42.55 
 
 		 115 aa  43.5  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>