63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0985 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  40.21 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  39 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  40.21 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0253  hypothetical protein  35.64 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  37.62 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 183 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  29.46 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 466 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 500 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 461 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  34.85 
 
 		 461 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  34.85 
 
 		 461 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 277 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  32.08 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0828  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 282 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 470 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  32.86 
 
 		 472 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 140 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  32.08 
 
 		 472 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 477 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03070  predicted transcriptional regulator  32.2 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 464 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 463 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  40.35 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 477 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 233 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 477 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>