127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2077 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  256  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  98.37 
 
 		 142 aa  245  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  92 
 
 		 130 aa  237  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  67.57 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  67.57 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  55.74 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3601  XRE family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000201761  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  47.13 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  40.21 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 468 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  31.45 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 321 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  42.37 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  38.98 
 
 		 489 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  52.5 
 
 		 466 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 475 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  43.86 
 
 		 475 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  43.86 
 
 		 475 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 474 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  38.6 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  37.5 
 
 		 475 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  43.86 
 
 		 475 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  43.86 
 
 		 482 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 477 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  42.19 
 
 		 475 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 477 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.07 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  36.07 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 474 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 424 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 474 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  37.7 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 470 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 477 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 470 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  40.35 
 
 		 483 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  40 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 271 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2266  helix-turn-helix domain protein  34.51 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0639842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  33.77 
 
 		 476 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 474 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 189 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.07 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 194 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3148  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  39.22 
 
 		 484 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5052  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>