18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4662 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  248  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  34.65 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  31.45 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  32.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  29.46 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 145 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  42.86 
 
 		 470 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 469 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>