41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0895 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 503 aa  1010    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  56.22 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  32.62 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  52.46 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  28.9 
 
 		 524 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2887  hypothetical protein  44.2 
 
 		 249 aa  123  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00393929  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2541  hypothetical protein  63.29 
 
 		 94 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  28.05 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  28.24 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 473 aa  88.6  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  26.84 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  29.29 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  28.43 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.72 
 
 		 418 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  35.06 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  26.13 
 
 		 342 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  31.65 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  30.61 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  39.08 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  33.15 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  27.06 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  26.89 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  27.98 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  28.57 
 
 		 478 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 401 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  29.06 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  26.3 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  30.13 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  26.84 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  26.64 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  28.7 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  25.37 
 
 		 388 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.85 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  23.93 
 
 		 554 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 282 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>