39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2626 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  82.5 
 
 
519 aa  826    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1041    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  54.42 
 
 
484 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  54.79 
 
 
503 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  41.52 
 
 
526 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  39.85 
 
 
537 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  81.69 
 
 
346 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  39.59 
 
 
503 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  77.4 
 
 
535 aa  230  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  73.97 
 
 
527 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  44.84 
 
 
514 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  43.46 
 
 
342 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  52.76 
 
 
175 aa  154  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  63.87 
 
 
255 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  51.22 
 
 
181 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  53.37 
 
 
509 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  65.57 
 
 
565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  78.05 
 
 
148 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  30.74 
 
 
434 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  30.29 
 
 
473 aa  89.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  26.84 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  29.05 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  26.71 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  29.7 
 
 
288 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  34.26 
 
 
181 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 
449 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  31.15 
 
 
400 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  34.26 
 
 
228 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  26.44 
 
 
363 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  28.22 
 
 
457 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  25.47 
 
 
449 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  23.47 
 
 
397 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  23.13 
 
 
412 aa  50.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  23.68 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.37 
 
 
418 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  27.49 
 
 
403 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  32.38 
 
 
505 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  26.87 
 
 
478 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>