18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5975 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  68.1 
 
 
181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  46.9 
 
 
554 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  41.07 
 
 
537 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  39.62 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  35.78 
 
 
346 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  34.82 
 
 
535 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  34.82 
 
 
527 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  34.26 
 
 
526 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  34.26 
 
 
519 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  34.69 
 
 
505 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  34.75 
 
 
514 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  33.61 
 
 
503 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  32.41 
 
 
519 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  36.96 
 
 
509 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  33.02 
 
 
484 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  31.48 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  35.44 
 
 
316 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>